MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sphingopyxis alaskensis RB2256 chromosome

Total Repeats: 83599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008048	CG	3	6	201	206	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
2	NC_008048	GC	3	6	285	290	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
3	NC_008048	GTG	2	6	299	304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485499
4	NC_008048	AACG	2	8	344	351	50 %	0 %	25 %	25 %	103485499
5	NC_008048	GGC	2	6	378	383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485499
6	NC_008048	CAGCGT	2	12	403	414	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	103485499
7	NC_008048	GCG	3	9	417	425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485499
8	NC_008048	GGC	2	6	427	432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485499
9	NC_008048	GC	3	6	439	444	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
10	NC_008048	GCCG	2	8	484	491	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
11	NC_008048	GCT	2	6	511	516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485499
12	NC_008048	GTC	2	6	551	556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485499
13	NC_008048	GC	3	6	557	562	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
14	NC_008048	CGC	2	6	574	579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485499
15	NC_008048	CGC	2	6	583	588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485499
16	NC_008048	GC	3	6	587	592	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
17	NC_008048	GGGCA	2	10	650	659	20 %	0 %	60 %	20 %	103485499
18	NC_008048	GCC	2	6	695	700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485499
19	NC_008048	CGA	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485499
20	NC_008048	CGG	2	6	732	737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485499
21	NC_008048	TCG	2	6	756	761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485499
22	NC_008048	GCG	3	9	771	779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485499
23	NC_008048	ATG	2	6	782	787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485499
24	NC_008048	GC	3	6	805	810	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
25	NC_008048	TGC	2	6	822	827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485499
26	NC_008048	CGA	2	6	829	834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485499
27	NC_008048	AGG	2	6	867	872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485499
28	NC_008048	CGA	2	6	889	894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485499
29	NC_008048	TGA	2	6	897	902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485499
30	NC_008048	CGG	2	6	903	908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485499
31	NC_008048	GTC	2	6	920	925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485499
32	NC_008048	CCG	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485499
33	NC_008048	CGGG	2	8	987	994	0 %	0 %	75 %	25 %	103485499
34	NC_008048	TCG	2	6	996	1001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485499
35	NC_008048	GAT	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485499
36	NC_008048	CAT	2	6	1039	1044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485499
37	NC_008048	CGC	2	6	1057	1062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485499
38	NC_008048	CGA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485499
39	NC_008048	CTGG	2	8	1099	1106	0 %	25 %	50 %	25 %	103485499
40	NC_008048	GC	3	6	1143	1148	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
41	NC_008048	CAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	103485499
42	NC_008048	GCT	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485499
43	NC_008048	GC	4	8	1182	1189	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
44	NC_008048	GC	3	6	1238	1243	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
45	NC_008048	CGA	2	6	1258	1263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485499
46	NC_008048	GC	3	6	1270	1275	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
47	NC_008048	GC	3	6	1281	1286	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
48	NC_008048	CG	3	6	1331	1336	0 %	0 %	50 %	50 %	103485499
49	NC_008048	CGCC	2	8	1339	1346	0 %	0 %	25 %	75 %	103485499
50	NC_008048	CGC	2	6	1383	1388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485499
51	NC_008048	CGC	2	6	1504	1509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485499
52	NC_008048	GCC	2	6	1736	1741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485500
53	NC_008048	AGGGC	2	10	1786	1795	20 %	0 %	60 %	20 %	103485500
54	NC_008048	TGA	2	6	1822	1827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485500
55	NC_008048	CAC	2	6	1835	1840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485500
56	NC_008048	CAT	2	6	1850	1855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485500
57	NC_008048	GCC	2	6	1860	1865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485500
58	NC_008048	CGC	2	6	1894	1899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485500
59	NC_008048	CG	5	10	1905	1914	0 %	0 %	50 %	50 %	103485500
60	NC_008048	GGA	2	6	1930	1935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	103485500
61	NC_008048	CGG	3	9	1972	1980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485500
62	NC_008048	GCG	2	6	1988	1993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485500
63	NC_008048	GCC	2	6	2046	2051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485500
64	NC_008048	CG	4	8	2066	2073	0 %	0 %	50 %	50 %	103485500
65	NC_008048	TCG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485500
66	NC_008048	CG	3	6	2098	2103	0 %	0 %	50 %	50 %	103485500
67	NC_008048	CCG	2	6	2106	2111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485500
68	NC_008048	GAT	2	6	2132	2137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485500
69	NC_008048	ACG	2	6	2154	2159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485500
70	NC_008048	GCC	2	6	2192	2197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485500
71	NC_008048	TCG	2	6	2211	2216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485500
72	NC_008048	CGC	2	6	2223	2228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485500
73	NC_008048	CCT	2	6	2263	2268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103485500
74	NC_008048	GGC	2	6	2291	2296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485500
75	NC_008048	AGCC	2	8	2298	2305	25 %	0 %	25 %	50 %	103485500
76	NC_008048	TTG	2	6	2331	2336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	103485500
77	NC_008048	ATC	2	6	2544	2549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485501
78	NC_008048	GCT	2	6	2609	2614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485501
79	NC_008048	GCG	2	6	2637	2642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485501
80	NC_008048	GC	3	6	2651	2656	0 %	0 %	50 %	50 %	103485501
81	NC_008048	GC	3	6	2689	2694	0 %	0 %	50 %	50 %	103485501
82	NC_008048	CCG	2	6	2740	2745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485501
83	NC_008048	GGC	2	6	2794	2799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485501
84	NC_008048	GAC	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485501
85	NC_008048	CGA	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485501
86	NC_008048	CGG	2	6	2936	2941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485501
87	NC_008048	TGCG	2	8	2970	2977	0 %	25 %	50 %	25 %	103485501
88	NC_008048	GC	3	6	2996	3001	0 %	0 %	50 %	50 %	103485501
89	NC_008048	AGC	2	6	3030	3035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485501
90	NC_008048	TCGA	2	8	3052	3059	25 %	25 %	25 %	25 %	103485501
91	NC_008048	GC	5	10	3152	3161	0 %	0 %	50 %	50 %	103485501
92	NC_008048	GTTCGA	2	12	3187	3198	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	103485501
93	NC_008048	GCC	2	6	3218	3223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485502
94	NC_008048	CTG	3	9	3253	3261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485502
95	NC_008048	TTG	2	6	3278	3283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	103485502
96	NC_008048	AGC	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485502
97	NC_008048	CGC	2	6	3307	3312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485502
98	NC_008048	ATG	2	6	3323	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485502
99	NC_008048	CGG	2	6	3378	3383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485502
100	NC_008048	AGC	2	6	3437	3442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485502
101	NC_008048	CGG	2	6	3460	3465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485502
102	NC_008048	TGG	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485502
103	NC_008048	AGA	2	6	3594	3599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	103485502
104	NC_008048	GGCA	2	8	3620	3627	25 %	0 %	50 %	25 %	103485502
105	NC_008048	TCT	2	6	3645	3650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485502
106	NC_008048	TCA	2	6	3666	3671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485502
107	NC_008048	CTG	2	6	3676	3681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485502
108	NC_008048	GTC	2	6	3694	3699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485502
109	NC_008048	GAC	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485502
110	NC_008048	CGA	2	6	3757	3762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485502
111	NC_008048	CAG	2	6	3790	3795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485502
112	NC_008048	GAT	2	6	3799	3804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485502
113	NC_008048	AGC	2	6	3863	3868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485502
114	NC_008048	GTC	2	6	3940	3945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485502
115	NC_008048	TCG	2	6	3996	4001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485502
116	NC_008048	CG	3	6	4040	4045	0 %	0 %	50 %	50 %	103485502
117	NC_008048	TCG	2	6	4065	4070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485502
118	NC_008048	CGC	2	6	4084	4089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485502
119	NC_008048	CAGC	2	8	4150	4157	25 %	0 %	25 %	50 %	103485502
120	NC_008048	GTC	2	6	4201	4206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485502
121	NC_008048	GTCG	2	8	4288	4295	0 %	25 %	50 %	25 %	103485502
122	NC_008048	GCT	2	6	4324	4329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485502
123	NC_008048	CAC	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485502
124	NC_008048	GGT	2	6	4456	4461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485502
125	NC_008048	CGTTC	2	10	4474	4483	0 %	40 %	20 %	40 %	103485502
126	NC_008048	GGC	2	6	4552	4557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485502
127	NC_008048	GCC	2	6	4564	4569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485502
128	NC_008048	CTT	2	6	4600	4605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485502
129	NC_008048	GTC	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485502
130	NC_008048	GC	4	8	4645	4652	0 %	0 %	50 %	50 %	103485502
131	NC_008048	CGA	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485502
132	NC_008048	ACG	2	6	4718	4723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485502
133	NC_008048	GCC	2	6	4745	4750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485502
134	NC_008048	GCC	2	6	4760	4765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485502
135	NC_008048	GC	3	6	4779	4784	0 %	0 %	50 %	50 %	103485502
136	NC_008048	GC	3	6	4818	4823	0 %	0 %	50 %	50 %	103485502
137	NC_008048	CGA	2	6	4887	4892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485502
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262	NC_008048	CG	3	6	9811	9816	0 %	0 %	50 %	50 %	103485510
263	NC_008048	CCGC	2	8	9817	9824	0 %	0 %	25 %	75 %	103485510
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265	NC_008048	ATC	2	6	9883	9888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485510
266	NC_008048	CGC	2	6	9899	9904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485510
267	NC_008048	GC	3	6	9908	9913	0 %	0 %	50 %	50 %	103485510
268	NC_008048	CGC	2	6	9927	9932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485510
269	NC_008048	GC	3	6	9963	9968	0 %	0 %	50 %	50 %	103485510
270	NC_008048	TCA	2	6	9989	9994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485510
271	NC_008048	GC	3	6	10107	10112	0 %	0 %	50 %	50 %	103485511
272	NC_008048	CG	3	6	10121	10126	0 %	0 %	50 %	50 %	103485511
273	NC_008048	CCA	2	6	10155	10160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485511
274	NC_008048	CCG	2	6	10174	10179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485511
275	NC_008048	GCA	2	6	10205	10210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485511
276	NC_008048	CGG	3	9	10226	10234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485511
277	NC_008048	CAC	2	6	10257	10262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485511
278	NC_008048	GCATC	2	10	10268	10277	20 %	20 %	20 %	40 %	103485511
279	NC_008048	CGTCGG	2	12	10387	10398	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	103485512
280	NC_008048	CG	3	6	10455	10460	0 %	0 %	50 %	50 %	103485512
281	NC_008048	CAG	2	6	10502	10507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485512
282	NC_008048	CG	3	6	10516	10521	0 %	0 %	50 %	50 %	103485512
283	NC_008048	GGC	2	6	10538	10543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485512
284	NC_008048	GCG	2	6	10626	10631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485512
285	NC_008048	TCA	2	6	10729	10734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485512
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288	NC_008048	CGC	2	6	10841	10846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485512
289	NC_008048	ACC	2	6	10857	10862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	103485512
290	NC_008048	CGA	2	6	10873	10878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485512
291	NC_008048	GGC	2	6	10892	10897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485512
292	NC_008048	GAT	2	6	10955	10960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	103485512
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295	NC_008048	CGG	2	6	11015	11020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485512
296	NC_008048	ATC	2	6	11037	11042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485512
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299	NC_008048	CTT	2	6	11155	11160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	103485513
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301	NC_008048	CG	3	6	11212	11217	0 %	0 %	50 %	50 %	103485513
302	NC_008048	CTG	2	6	11223	11228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485513
303	NC_008048	ACG	2	6	11250	11255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	103485513
304	NC_008048	GCGCG	2	10	11275	11284	0 %	0 %	60 %	40 %	103485513
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346	NC_008048	CCG	2	6	13168	13173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485515
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372	NC_008048	ATC	2	6	14092	14097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	103485517
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387	NC_008048	TCG	2	6	14727	14732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485518
388	NC_008048	GCG	2	6	14743	14748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485518
389	NC_008048	CG	4	8	14766	14773	0 %	0 %	50 %	50 %	103485518
390	NC_008048	CGG	3	9	14788	14796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485518
391	NC_008048	CCT	2	6	14809	14814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	103485518
392	NC_008048	TGG	2	6	14826	14831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	103485518
393	NC_008048	CGG	2	6	14857	14862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	103485518
394	NC_008048	CGT	2	6	14879	14884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	103485518
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398	NC_008048	CG	3	6	14950	14955	0 %	0 %	50 %	50 %	103485518
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400	NC_008048	G	6	6	14989	14994	0 %	0 %	100 %	0 %	103485518
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474	NC_008048	CG	4	8	17558	17565	0 %	0 %	50 %	50 %	103485521
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499	NC_008048	CCG	3	9	18210	18218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	103485521
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